Sebagai upaya mencegah penularan penyakit melalui gigitan nyamuk yang cukup berbahaya, SIT al-Madinah Tanjungpinang, melakukan fogging pada sore hari ketika siswa dan guru sedang diliburkan.
Kegiatan fogging ini dilaksanakan bersama Dinas terkait guna menyuplai segala keperluan. Lokasi yang dilakukan fogging ialah seluruh saluran sanitasi air, WC, kelas-kelas, dan ruang kantor.
